差分

31,544 バイト追加、 2020年4月22日 (水) 22:47

→‎記述疫学

==最終更新日時==

2020年3月14日 02:37

</span></blockquote>

==主要医学誌リンク集==

{|class="wikitable" style="max-width:800px;"

!New England Journal of Medicine

|[https://www.nejm.org/coronavirus NEJM - 2019 Novel Coronavirus (2019-nCoV)]

|-

!LANCET

|[https://www.thelancet.com/coronavirus THE LANCET COVID-19 Resource Centre]

|-

!JAMA

|[https://jamanetwork.com/journals/jama/pages/coronavirus-alert JAMA The 2019 Novel Coronavirus (2019-nCoV)]

|-

!BMJ

|[https://www.bmj.com/coronavirus The BMJ Coronavirus]

|-

!medRxiv

|[https://www.medrxiv.org/search/coronavirus%20numresults%3A10%20sort%3Apublication-date%20direction%3Adescending medRxiv - "coronavirus"]

*medRxivはCold Spring Harbor研究所，Yale大学，BMJが共同で運用する，医科学論文をpeer-reviewを経ずに迅速に掲載するpreprintサービス

*どの論文もpeer-reviewを受けていないので，論文内容の解釈には注意が必要

|-

!Imperial College London

|[https://www.imperial.ac.uk/mrc-global-infectious-disease-analysis/news--wuhan-coronavirus/ MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis｜News]

|-

!日本感染症学会症例報告集

|[http://www.kansensho.or.jp/modules/topics/index.php?content_id=31#case_reports 症例報告]

|}

==記述疫学==

{|class="wikitable"

!style="width:~~60px~~4em;"|文献番号!style="width:~~40px~~3em;"|発表日!style="min-width:~~280px~~20em;"|概要!style="~~min~~max-width:~~300px~~15em;"|Citation

!PDF

|-

</div>

|[https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30183-5/fulltext Huang, Chaolin, et al. “Clinical Features of Patients Infected with 2019 Novel Coronavirus in Wuhan, China.” The Lancet, 24 Jan. 2020, doi:10.1016/s0140-6736(20)30183-5.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/9/92/200124_nCoV%E6%AD%A6%E6%BC%A2%E6%9C%80%E5%88%9D%E6%9C%9F41%E4%BA%BA%E3%81%AE%E8%A8%98%E8%BF%B0%E7%96%AB%E5%AD%A6_%282020%2C_Huang%29.pdfDL]

|-

!Epi-2

</div>

|[https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30154-9/fulltext Chan, Jasper Fuk-Woo, et al. “A Familial Cluster of Pneumonia Associated with the 2019 Novel Coronavirus Indicating Person-to-Person Transmission: a Study of a Family Cluster.” The Lancet, 24 Jan. 2020, doi:10.1016/s0140-6736(20)30154-9.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/9/97/200124_nCoV%E6%9C%80%E5%88%9D%E3%81%AE%E5%AE%B6%E6%97%8F%E5%86%85%E9%9B%86%E7%A9%8D%E4%BA%8B%E4%BE%8B_%282020%2C_Chan%29.pdfDL]

|-

!Epi-3

</div>

|[https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMc2001272 Phan, Lan T., et al. “Importation and Human-to-Human Transmission of a Novel Coronavirus in Vietnam.” New England Journal of Medicine, 28 Jan. 2020, doi:10.1056/nejmc2001272.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/9/96/200128_nCoV%E3%83%99%E3%83%88%E3%83%8A%E3%83%A0%E3%83%92%E3%83%88%EF%BC%8D%E3%83%92%E3%83%88%E6%84%9F%E6%9F%93%E4%BA%8B%E4%BE%8B_%282020%2C_Phan%29.pdfDL]

|-

!Epi-4

</div>

|[https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2001316 Li, Qun, et al. “Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus–Infected Pneumonia.” New England Journal of Medicine, 29 Jan. 2020, doi:10.1056/nejmoa2001316.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/3/39/200129_nCoV%E6%AD%A6%E6%BC%A2%E5%88%9D%E6%9C%9F425%E4%BA%BA%E3%81%AE%E8%A8%98%E8%BF%B0%E7%96%AB%E5%AD%A6_%282020%2C_Li%29.pdfDL]

|-

!Epi-5

</div>

|[https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30211-7/fulltext Chen, Nanshan, et al. “Epidemiological and Clinical Characteristics of 99 Cases of 2019 Novel Coronavirus Pneumonia in Wuhan, China: a Descriptive Study.” The Lancet, 30 Jan. 2020, doi:10.1016/s0140-6736(20)30211-7.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/4/47/200130_nCoV%E6%AD%A6%E6%BC%A2%E5%88%9D%E6%9C%9F99%E4%BA%BA%E3%81%AE%E8%A8%98%E8%BF%B0%E7%96%AB%E5%AD%A6_%282020%2C_Chen%29.pdfDL]

|-

!Epi-6

</div>

|[https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2761044 Wang, Dawei, et al. “Clinical Characteristics of 138 Hospitalized Patients With 2019 Novel Coronavirus–Infected Pneumonia in Wuhan, China.” JAMA, 7 Feb. 2020, doi:10.1001/jama.2020.1585.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/3/3f/200207_nCoV%E6%AD%A6%E6%BC%A2138%E4%BA%BA%E3%81%AE%E8%A8%98%E8%BF%B0%E7%96%AB%E5%AD%A6_%282020%2C_Wang%29.pdfDL]

|-

!Epi-7

</div>

|[https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2761043 Chang, De, et al. “Epidemiologic and Clinical Characteristics of Novel Coronavirus Infections Involving 13 Patients Outside Wuhan, China.” JAMA, 7 Feb. 2020, doi:10.1001/jama.2020.1623.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/1/1b/200207_nCoV%E5%8C%97%E4%BA%AC13%E4%BA%BA%E3%81%AE%E8%A8%98%E8%BF%B0%E7%96%AB%E5%AD%A6_%282020%2C_Chang%29.pdfDL]

|-

!Epi-8

</div>

|[https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.06.20020974v1 Guan, Wei-Jie, Zheng-Yi Ni, Yu Hu, Wen-Hua Liang, Chun-Quan Ou, Jian-Xing He, Lei Liu, et al. “Clinical Characteristics of 2019 Novel Coronavirus Infection in China.” MedRxiv (Non-Peer-Reviewed Preprint Service), February 9, 2020. https://doi.org/10.1101/2020.02.06.20020974.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/b/b1/200209_nCoV31%E7%9C%81%E5%8C%BA%E5%B8%821099%E4%BA%BA%E3%81%AE%E8%A8%98%E8%BF%B0%E7%96%AB%E5%AD%A6_%282020%2C_Guan%29.pdfDL]

|-

!Epi-9

|-

!Epi-10

|3/11

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|武漢での1月中入院患者の死亡等リスク因子；歴史的コホート研究

*武漢の2病院で1/31までに死亡又は退院した18歳以上成人患者191人の歴史的コホート

*退院137人，死亡54人

*基礎疾患あり91人（48%）

*多変量回帰分析にて入院中死亡に有意に相関した因子とオッズ比（95%CI）：

**高齢 1.10 (1.03-1.17)

**高SOFAスコア 5.56 (2.61-12.23)

**d-dimer>1µg/mL 18.42 (2.64-128.55)

*生存退院患者でのviral shedding time 中央値20.0日（四分位17.0-24.0日）

</div>

|[https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30566-3/fulltext Zhou, Fei, Ting Yu, Ronghui Du, Guohui Fan, Ying Liu, Zhibo Liu, Jie Xiang, et al. “Clinical Course and Risk Factors for Mortality of Adult Inpatients with COVID-19 in Wuhan, China: a Retrospective Cohort Study.” The Lancet, March 11, 2020. https://doi.org/10.1016/s0140-6736(20)30566-3.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/c/cf/200311_CoV2_%E6%AD%A6%E6%BC%A21%E6%9C%88%E4%B8%AD%E3%81%AE%E6%AD%BB%E4%BA%A1%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%82%AF%E5%9B%A0%E5%AD%90_%282020%2C_Zhou%29.pdf DL]

|-

!Epi-11

|3/9

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|55か国8,597人の武漢からのrepatriation flightsでの感染率（陽性率）

*1/29-2/27の間に55か国56便で8,597人が武漢から母国等へrepatriation

*うち47便5,720人で検査

**陽性0.63% (95%CI 0.44-0.87)

*47便中32便のみで全帰還者検査

**陽性0.60% (95%CI 0.41-0.86)

*47便中30便のみで解析時点で14日隔離を完了

**陽性0.61% (95%CI 0.41-0.88)

*47便中20便のみで帰還直後検査

**陽性0.53% (95%CI 0.28-0.91)

*47便中6便が武漢ピークの1/30-2/1の3日間に帰還

**陽性0.87% (95%CI 0.32-1.89)

</div>

|[https://www.imperial.ac.uk/media/imperial-college/medicine/sph/ide/gida-fellowships/Imperial-College-COVID19-repatriation-09-03-2020.pdf Thompson, Hayley, Natsuko Imai, Amy Dighe, Marc Baguelin, Sangeeta Bhatia, and Adhiratha Boonyasiri. “Report 7: Estimating Infection Prevalence in Wuhan City from Repatriation Flights.” Imperial College LondonCOVID-19 Response Team, 2020.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/c/cc/200309_CoV2_%E6%AD%A6%E6%BC%A2%E3%81%8B%E3%82%89%E3%81%AErepat_flights%E3%81%A7%E3%81%AE%E9%99%BD%E6%80%A7%E7%8E%87_%282020%2C_Thompson%29.pdf DL]

|-

!Epi-12

|2/24

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|中国72314例エピカーブ

</div>

|[https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2762130 Wu, Zunyou, and Jennifer M. Mcgoogan. “Characteristics of and Important Lessons From the Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Outbreak in China.” Jama, February 24, 2020. https://doi.org/10.1001/jama.2020.2648.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/8/84/200224_CoV2_%E4%B8%AD%E5%9B%BD72314%E4%BE%8B%E3%82%A8%E3%83%94%E3%82%AB%E3%83%BC%E3%83%96.pdf DL]

|-

!Epi-13

|4/9

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|ドイツのアウトブレイクでepi-centerとなった小町GangeltでのIgG等による疫学研究（preprint）

*Gangeltは2月15日のカーニバルが発端となってアウトブレイクが発生

*人口12,529人中約600世帯をランダム抽出し，うち約400世帯1,000人が研究参加

*約14%がSARS-CoV-2 IgG抗体陽性；うち約2%は既にPCR陽性

*Overall感染率は約15%

*感染者ベースの致死率 case-fatality rate 0.37%

*Gangelt人口ベースの死亡率 mortality rate 0.09%

*※抗体検査時期の明記なし

*Preprintであり，peer-reviewed掲載はこれから

</div>

|[https://www.land.nrw/sites/default/files/asset/document/zwischenergebnis_covid19_case_study_gangelt_0.pdf Vorläufiges Ergebnis und Schlussfolgerungen der COVID-19 Case-Cluster-Study (Gemeinde Gangelt)]

|

|-

!Epi-14

|

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|

==症例報告==

{{quote

|content=

[http://www.kansensho.or.jp/modules/topics/index.php?content_id=31#case_reports 日本感染症学会｜COVID-19症例報告集]

</span>

}}

{|class="wikitable"

!style="width:~~60px~~4em;"|文献番号!style="width:~~40px~~3em;"|発表日!style="min-width:~~280px~~20em;"|概要!style="~~min~~max-width:~~300px~~15em;"|Citation

!PDF

|-

!Case-1

|2/5

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|国立国際医療研究センター病院に1月29日～31日に入院した3例の症例報告

*3例とも武漢での感染

*1例は初期は上気道炎のみ，肺炎に進展し診断確定するまでに1週間を要した

**ロピナビル/リトナビル（LPV/r）を投与

*1例は上気道炎のみで経過し，軽快

**LPV/r投与せず

*1例は上気道炎で発症，経過中に軽度の肺炎に進展した

**酸素は不要で，LPV/rも投与せず

*中国での報告は重症例に偏っていることが示唆される

*日本国内でのまん延の可能性を指摘し，提言

**封じ込めを目的としない

**致命率の低下と医療体制の維持を

***重症例：感染症指定医療機関等

***軽症例：すべての医療機関

*標準予防策の徹底，接触感染予防策，飛沫感染予防策の遵守を

</div>

|[http://www.kansensho.or.jp/uploads/files/topics/2019ncov/2019ncov_casereport_200205.pdf 中村啓二, et al. “当院における新型コロナウイルス(2019-NCoV)感染症患者3例の報告.” 5 Feb. 2020, http://www.kansensho.or.jp/uploads/files/topics/2019ncov/2019ncov_casereport_200205.pdf.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/b/b2/200205_NCGM%E7%97%87%E4%BE%8B%E5%A0%B1%E5%91%8A.pdf DL]

|-

!Case-2

|2/12

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|台湾国内での<span style="color:red;">発症前の</span>夫婦間感染の症例報告

*Index case:52歳女性、2型糖尿病あり

**2019年10月21日-2020年1月20日武漢市に滞在。1月20日航空機で台湾に帰国。

**Index caseと同乗した他の乗客が1月20日中に咽頭ぬぐい液を採取され、21日SARS-CoV-2陽性；台湾として初の輸入例。

**帰国5日後の25日に発熱、筋肉痛出現。咳嗽、呼吸苦、胸痛、下痢なし。胸部X線にて両側下肺のびまん性浸潤影あり。入院。

**呼吸器病原体パネルでインフルエンザ、アデノ、ライノ、パラインフルエンザ、RSV、百日咳、肺炎クラミジア、マイコプラズマすべて陰性。

**27日（入院day 3）咽頭ぬぐい液のrRT-PCR法にてSARS-CoV-2を検出、陽性；台湾として5例目のCOVID-19輸入例。

**Day 5 胸部X線にて進行性のびまん性間質陰影、及び両肺門部＋下肺野の浸潤影あり。

**酸素投与は要しないまま2月11日（論文発表前日）時点で入院継続中。

*Secondary case：50歳男性、index caseの夫

**妻と異なりSARS-CoV-2流行地への滞在歴はなく、滞在者との明らかな接触もなし。

**1月21日以降妻と濃厚接触あり。

**1月25日妻と同時に受診したが、主訴は鼻汁のみ。発熱、咳嗽、呼吸苦、胸痛、下痢なし。

**同時受診の妻がCOVID-19疑いであったため、観察のため同じく入院となった。

**入院後胸部X線、血算正常、呼吸器病原体パネル陰性。

**1月28日rRT-PCR法にてSARS-CoV-2を検出。

**入院後に筋肉痛は出現したが、発熱は通じてなく、酸素投与も要していない。2月11日時点で入院継続中。

*'''夫は1月21日以降に発症前の妻と濃厚接触し、25日に夫婦同時に発症している'''。

*論文発表時点で、夫婦からの二次感染例は発見されていない。

</div>

|[https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMc2001573 Liu, Ying-Chu, Ching-Hui Liao, Chin-Fu Chang, Chu-Chung Chou, and Yan-Ren Lin. “A Locally Transmitted Case of SARS-CoV-2 Infection in Taiwan.” New England Journal of Medicine, February 12, 2020. https://doi.org/10.1056/nejmc2001573.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/5/5a/200212_%E5%8F%B0%E6%B9%BE%E3%81%A7%E3%81%AE%E7%99%BA%E7%97%87%E5%89%8D%E5%A4%AB%E5%A9%A6%E9%96%93%E6%84%9F%E6%9F%93_%282020%2C_Liu%29.pdf DL]

|-

!Case-3

|2/12

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|タイ国内でのタクシー運転手の症例報告

*タイ在住の51歳男性タクシー運転手、中国への渡航歴なし

*中国から来タイし咳が持続していた中国人をタクシーに乗せたことあり（時期不詳）。当該中国人はマスクを装用していた。

*1月20日発熱、咳嗽、筋肉痛が出現。薬局でOTC薬を購入。

*1月23日症状持続するためバンコクのプライマリケア診療所を受診。体温36.8℃。Flu RDT陰性。

*1月24-27日気分不快のためタクシー乗務できず自宅静養。

*1月28日バンコクの総合病院に受診、COVID-19疑い患者として国立の感染症研究所へ移送。

*移送先で発熱、軽度呼吸苦あり。胸部X線にて左下肺に網状斑状の浸潤影あり。咽頭及び鼻腔ぬぐい液にてSARS-CoV-2陽性。

*本人が自覚していなかった高血圧と2型糖尿病が入院後に判明。

*経過は良好で2月5日退院。濃厚接触者からの発症は認めていない。

</div>

|[https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMc2001621?query=featured_home Pongpirul, Wannarat A., Krit Pongpirul, Anuttra C. Ratnarathon, and Wisit Prasithsirikul. “Journey of a Thai Taxi Driver and Novel Coronavirus.” New England Journal of Medicine, February 12, 2020. https://doi.org/10.1056/nejmc2001621.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/4/4f/200212_%E3%82%BF%E3%82%A4%E5%9B%BD%E5%86%85%E3%81%A7%E3%81%AE%E3%82%BF%E3%82%AF%E3%82%B7%E3%83%BC%E9%81%8B%E8%BB%A2%E6%89%8B%E3%81%AE%E7%97%87%E4%BE%8B%E5%A0%B1%E5%91%8A_%282020%2C_Ratnarathon%29.pdf DL]

|-

!Case-4

|2/27

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|医療従事者感染4例の快復後のウイルスゲノム検出

*武漢での医療従事者感染4例（男2・女2；30-36歳）

*4例ともCT上GGOあり；3例有症状，1例無症状

*2連続PCR陰性を確認して退院or自宅隔離解除

*発症から2連続PCR陰性確認まで12-32日間

*2連続PCR陰性確認後，5-13日後の再検PCRで4例とも再陽性

*再陽性確認後，4例とも4-5日ごとに計3回PCR再検し，4例3回とも陽性

*異なるメーカーのキットを用いて再検したがやはり陽性

*再陽性が持続した間4例とも無症状で，新規患者との接触歴なし

*再陽性が持続した間4例の家族はいずれも感染を認めず；ただし医療従事者であったため家族内感染防止策は十分であった可能性

</div>

|[https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2762452 Lan, Lan, Dan Xu, Guangming Ye, Chen Xia, Shaokang Wang, Yirong Li, and Haibo Xu. “Positive RT-PCR Test Results in Patients Recovered From COVID-19.” Jama, February 27, 2020. https://doi.org/10.1001/jama.2020.2783.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/e/ef/200227_CoV2_%E5%BF%AB%E5%BE%A9%E5%BE%8C%E6%82%A3%E8%80%85%E3%81%8B%E3%82%89%E3%81%AE%E3%82%B2%E3%83%8E%E3%83%A0%E6%A4%9C%E5%87%BA_%282020%2C_Lan%29.pdf DL]

|-

!Case-5

|

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|~~あいうえお~~

</div>

|

|[ DL]

|}

==診断学==

{|class="wikitable"

!style="width:4em;"|文献番号

!style="width:3em;"|発表日

!style="min-width:20em;"|概要

!style="max-width:15em;"|Citation

!PDF

|-

!Dx-1

|1/22

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|

武漢でのnCoV陽性例のCT画像

</div>

|[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4NzEzMzI5NQ%3D%3D&mid=2651701675&idx=1&sn=107391e0b05de8f5043175d874a738ad 史河水, et al. “武汉19-NCoV 肺炎影像学表现初探.” 微信公众平台, 22 Jan. 2020, mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4NzEzMzI5NQ==&mid=2651701675&idx=1&sn=107391e0b05de8f5043175d874a738ad.]

|

|-

!Dx-2

|2/12

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|

PCR陰性＋典型CT画像→後日PCR陽性となった5例の画像

</div>

|[https://pubs.rsna.org/doi/full/10.1148/radiol.2020200343 Xie, Xingzhi, et al. “Chest CT for Typical 2019-NCoV Pneumonia: Relationship to Negative RT-PCR Testing.” Radiology, 12 Feb. 2020, p. 200343., doi:10.1148/radiol.2020200343.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/b/b2/200212_nCoV%E5%BE%8C%E6%97%A5PCR%E9%99%BD%E6%80%A7%E3%81%A8%E3%81%AA%E3%81%A3%E3%81%9F%E5%85%B8%E5%9E%8BCT%E7%94%BB%E5%83%8F%E4%BE%8B_%282020%2C_Xie%29.pdf DL]

|-

!Dx-3

|

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|

</div>

|~~URL~~|~~PDF~~[ DL]

|}

==数理モデル==

{|class="wikitable"

!style="width:~~60px~~4em;"|文献番号!style="width:~~40px~~3em;"|発表日!style="min-width:~~280px~~20em;"|概要!style="~~min~~max-width:~~300px~~15em;"|Citation

!PDF

|-

!Math-1

|1/17

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|感染症数理モデルによるnCoV発生数の推定

*武漢市内だけで、1月12日までに、1,723人 (95%CI 427–4,471人) が2019-nCoV関連肺炎を発症しているという推計

</div>

|[https://www.imperial.ac.uk/mrc-global-infectious-disease-analysis/news--wuhan-coronavirus/ Imai, Natsuko M., et al. Report 1: Estimating the Potential Total Number of Novel Coronavirus Cases in Wuhan City, China. Imperial College London‌, 2020.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/2/28/200117_nCoV%E6%95%B0%E7%90%86%E3%83%A2%E3%83%87%E3%83%ABReport1_%282020%2C_Imai%29.pdf DL]

|-

!Math-2

|1/22

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|感染症数理モデルによるnCoV発生数の推定

*武漢市内だけで、1月18日までに、4,000人 (uncertainty range 1,000–9,700人) が2019-nCoV関連肺炎を発症しているという推計

</div>

|[https://www.imperial.ac.uk/mrc-global-infectious-disease-analysis/news--wuhan-coronavirus/ Imai, Natsuko M., et al. Report 2: Estimating the Potential Total Number of Novel Coronavirus Cases in Wuhan City, China. Imperial College London‌, 2020.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/7/75/200122_nCoV%E6%95%B0%E7%90%86%E3%83%A2%E3%83%87%E3%83%ABReport2_%282020%2C_Imai%29.pdf DL]

|-

!Math-3

|1/25

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|nCoVの基本再生産数R₀の推定

*1月18日時点の2019-nCoVの基本再生産数R₀は2.6（uncertainty range 1.5-3.5）と推定

</div>

|[https://www.imperial.ac.uk/mrc-global-infectious-disease-analysis/news--wuhan-coronavirus/ Imai, Natsuko, et al. Report 3: Transmissibility of 2019-NCoV. Imperial College London‌, 2020.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/c/c2/200125_nCoV%E5%9F%BA%E6%9C%AC%E5%86%8D%E7%94%9F%E7%94%A3%E6%95%B0_%282020%2C_Imai%29.pdf DL]

|-

!Math-4

|1/31

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|武漢1月28日時点の感染症数理モデル

</div>

|[https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30260-9/fulltext Wu, Joseph T, et al. “Nowcasting and Forecasting the Potential Domestic and International Spread of the 2019-NCoV Outbreak Originating in Wuhan, China: a Modelling Study.” The Lancet, 31 Jan. 2020, doi:10.1016/s0140-6736(20)30260-9.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/7/78/200131_nCoV%E6%95%B0%E7%90%86%E3%83%A2%E3%83%87%E3%83%AB_%282020%2C_Wu%29.pdf DL]

|-

!Math-5

|2/10

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|2月8日現在のCFR（致死率）の推定

</div>

|[https://www.imperial.ac.uk/mrc-global-infectious-disease-analysis/news--wuhan-coronavirus/ Dorigatti, Ilaria, Lucy Okell, Anne Cori, Natsuko Imai , Marc Baguelin, Sangeeta Bhatia, and Adhiratha Boonyasiri. “Report 4: Severity of 2019-Novel Coronavirus (NCoV).” Imperial College London‌, 2020.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/2/2c/200210_nCoV2%E6%9C%888%E6%97%A5%E7%8F%BE%E5%9C%A8CFR%E6%8E%A8%E5%AE%9A_%282020%2C_Dorigatti%29.pdf DL]

|-

!Math-6

|3/11

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|武漢での交通封鎖前後の効果的再生産数Rt

*交通封鎖1週間前Rt=2.35 (95%CI 1.15-4.77)

*交通封鎖1週間後Rt=1.05 (95%CI 0.14-2.39)

</div>

|[https://www.thelancet.com/journals/laninf/article/PIIS1473-3099(20)30144-4/fulltext Kucharski, Adam J, Timothy W Russell, Charlie Diamond, Yang Liu, John Edmunds, Sebastian Funk, Rosalind M Eggo, et al. “Early Dynamics of Transmission and Control of COVID-19: a Mathematical Modelling Study.” The Lancet Infectious Diseases, March 11, 2020. https://doi.org/10.1016/s1473-3099(20)30144-4.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/c/ce/200311_CoV2_%E6%AD%A6%E6%BC%A2%E3%81%AE%E5%8A%B9%E6%9E%9C%E7%9A%84%E5%86%8D%E7%94%9F%E7%94%A3%E6%95%B0Rt_%282020%2C_Kucharski%29.pdf DL]

|-

!Math-7

|随時<br>更新

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|日本における感染拡大抑制の数理モデル等に関する情報提供ウェブサイト

</div>

|[https://www.fttsus.jp/covinfo/ 佐藤彰洋. “COVID-19情報感染拡大抑制に関する研究・検討資料内容.” COVID-19情報共有 – By Prof. Dr. Aki-Hiro Sato. Accessed March 13, 2020. https://www.fttsus.jp/covinfo/.]

|

|-

!Math-8

|

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|~~あいうえお~~

</div>

|~~URL~~|~~PDF~~

|}

==ウイルス学==

{|class="wikitable"

!style="width:~~60px~~4em;"|文献番号!style="width:~~40px~~3em;"|発表日!style="min-width:~~280px~~20em;"|概要!style="~~min~~max-width:~~300px~~15em;"|Citation

!PDF

|-

!Vir-1

|1/22

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|ヘビがnCoV感染源の可能性

</div>

|[https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/jmv.25682 Ji, Wei, et al. “Homologous Recombination within the Spike Glycoprotein of the Newly Identified Coronavirus May Boost Cross‐Species Transmission from Snake to Human.” Journal of Medical Virology, 22 Jan. 2020, doi:10.1002/jmv.25682.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/b/b4/200122_nCoV%E6%84%9F%E6%9F%93%E6%BA%90%E3%83%98%E3%83%93%E3%81%AE%E5%8F%AF%E8%83%BD%E6%80%A7_%282020%2C_Ji%29.pdf DL]

|-

!Vir-2

|1/24

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|2019-nCoVの発見報告

*武漢市華南海鮮市場に関連のある原因不明肺炎患者3人の気道検体（気管支肺胞洗浄液, BALF）から，新型コロナウイルスを分離同定した報告

*患者はいずれも2019年12月27日入院，49歳女性（市場の販売員；快復退院），61歳男性（市場の頻回利用者；死亡），32歳男性（不詳；快復退院）

*3人から12月30日に採取した検体それぞれから2万以上のウイルスゲノム断片が検出され，ベータコロナウイルス属に合致，bat SARS-like CoVと85%以上の相同性あり

*ヒト気道上皮細胞を用いて'''ウイルス分離に成功，2019-nCoVと命名'''

*分離したウイルスを新たなヒト気道上皮細胞に接種したところ，96時間後に細胞障害性を確認

*電子顕微鏡で観察した2019-nCoV粒子は球状，直径60-140nm，特徴的なスパイク構造を認めた

*本研究段階ではまだ'''コッホの3原則を満たしておらず'''，今後下記研究が必要

**患者の'''肺組織からの2019-nCoV抗原の検出'''（免疫組織化学的手法）

**患者'''血清からの特異的IgM及びIgGの検出'''と，'''ペア血清によるseroconversionの確認'''

**動物実験（サル）による'''病原性の再現'''

</div>

|[https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2001017 Zhu, Na, et al. “A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019.” New England Journal of Medicine, 24 Jan. 2020, doi:10.1056/nejmoa2001017.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/e/ef/200124_nCoV%E7%99%BA%E8%A6%8B%E5%A0%B1%E5%91%8A_%282020%2C_Zhu%29.pdf DL]

|-

!Vir-3

|1/30

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|nCoVゲノム解析

</div>

|[https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30251-8/fulltext Lu, Roujian, et al. “Genomic Characterisation and Epidemiology of 2019 Novel Coronavirus: Implications for Virus Origins and Receptor Binding.” The Lancet, 30 Jan. 2020, doi:10.1016/s0140-6736(20)30251-8.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/4/46/200130_nCoV%E3%82%B2%E3%83%8E%E3%83%A0%E8%A7%A3%E6%9E%90_%282020%2C_Lu%29.pdf DL]

|-

!Vir-4

|3/4

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|3患者の入院病室の環境表面26か所でのウイルス検出

*2患者病室の入院中routine cleaning後は検出なし

*1患者病室の入院中routine cleaning前で室内環境表面15か所中13か所（換気口含む），トイレ5か所中3か所で検出あり

**この患者は下痢なかったが糞便2検体で陽性

*医療従事者PPE表面は靴表面1か所のみ陽性

*換気12回/時の陰圧環境下で空気サンプル検出なし

</div>

|[https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2762692 Ong, Sean Wei Xiang, Yian Kim Tan, Po Ying Chia, Tau Hong Lee, Oon Tek Ng, Michelle Su Yen Wong, and Kalisvar Marimuthu. “Air, Surface Environmental, and Personal Protective Equipment Contamination by Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) From a Symptomatic Patient.” Jama, March 4, 2020. https://doi.org/10.1001/jama.2020.3227.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/0/0f/200304_CoV2_3%E6%82%A3%E8%80%85%E7%97%85%E5%AE%A4%E7%92%B0%E5%A2%83%E8%A1%A8%E9%9D%A2%E3%81%8B%E3%82%89%E3%81%AECoV2%E6%A4%9C%E5%87%BA_%282020%2C_Ong%29.pdf DL]

|-

!Vir-5

|3/17

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|空気及び環境表面でのウイルス活性

*エアロゾル（飛沫核；径<5µm）は測定空気中で3時間経過後も検出（それ以上の経過時間では採取しなかったよう）

*ステンレス表面，プラスチック表面では72時間以上経過後も検出

*銅表面では4時間経過後に検出不可能に

*段ボール表面では24時間経過後に検出不可能に

</div>

|[https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMc2004973 DOI: 10.1056/NEJMc2004973]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/c/ce/200317_nCoV%E7%A9%BA%E6%B0%97%E5%8F%8A%E3%81%B3%E7%92%B0%E5%A2%83%E8%A1%A8%E9%9D%A2%E3%81%A7%E3%81%AE%E6%B4%BB%E6%80%A7_%282020%2C_van_Doremalen%29.pdf DL]

|-

!Vir-6

|4/2

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|環境表面でのウイルス活性

*印刷用紙表面，ティッシュペーパー表面からは3時間経過後に検出不可能に

*表面処理済み木材表面，衣類表面からは2日目に検出不可能に

*ガラス表面，紙幣表面からは4日目に検出不可能に

*ステンレス表面，プラスチック表面からは7日目に検出不可能に

*サージカルマスクの外表面からは7日目でも検出可能だった

</div>

|[https://www.thelancet.com/journals/lanmic/article/PIIS2666-5247(20)30003-3/fulltext DOI:https://doi.org/10.1016/S2666-5247(20)30003-3]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/0/0a/200402_nCoV%E7%92%B0%E5%A2%83%E8%A1%A8%E9%9D%A2%E3%81%A7%E3%81%AE%E6%B4%BB%E6%80%A7_%282020%2C_Chin%29.pdf DL]

|-

!Vir-7

|

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|~~あいうえお~~

</div>

|~~URL~~|~~PDF~~[ DL]

|}

==総説==

{|class="wikitable"

!style="width:~~60px~~4em;"|文献番号!style="width:~~40px~~3em;"|発表日!style="min-width:~~280px~~20em;"|概要!style="~~min~~max-width:~~300px~~15em;"|Citation

!PDF

|-

!Rev-1

|2/5

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|2019-nCoV 2月5日現在の総説

</div>

|[https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2760782 Rio, Carlos Del, and Preeti N. Malani. “2019 Novel Coronavirus—Important Information for Clinicians.” JAMA, 5 Feb. 2020, doi:10.1001/jama.2020.1490.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/7/75/200205_nCoV2%E6%9C%885%E6%97%A5%E7%8F%BE%E5%9C%A8%E7%B7%8F%E8%AA%AC_%282020%2C_Rio%29.pdf DL]

|-

!Rev-2

|3/8

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|COVID-19総説（3/10更新）

</div>

|[https://note.com/chugaiigaku/n/n8583a93b5a80 忽那賢志. “総説新型コロナウイルス感染症（COVID-19）｜中外医学社Online｜Note.” note. 中外医学社Online, March 8, 2020. https://note.com/chugaiigaku/n/n8583a93b5a80.]

|

|-

!Rev-3

|

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|~~あいうえお~~

</div>

|~~URL~~|~~PDF~~[ DL]

|}

==Editorial・Letter等==

{|class="wikitable"

!style="width:~~60px~~4em;"|文献番号!style="width:~~40px~~3em;"|発表日!style="min-width:~~280px~~20em;"|概要!style="~~min~~max-width:~~300px~~15em;"|Citation

!PDF

|-

!Edit-1

|1/24

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|リスク評価の要点

</div>

|[https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMp2000929 Munster, Vincent J., et al. “A Novel Coronavirus Emerging in China — Key Questions for Impact Assessment.” New England Journal of Medicine, 24 Jan. 2020, doi:10.1056/nejmp2000929.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/1/17/200124_nCoV%E3%83%AA%E3%82%B9%E3%82%AF%E8%A9%95%E4%BE%A1%E3%81%AE%E8%A6%81%E7 DL]

|-

!Edit-2

|2/7

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|nCoV肺障害にステロイドは有効ではない

</div>

|[https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30317-2/fulltext Russell, Clark D, et al. “Clinical Evidence Does Not Support Corticosteroid Treatment for 2019-NCoV Lung Injury.” The Lancet, 7 Feb. 2020, doi:10.1016/s0140-6736(20)30317-2.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/7/74/200207_nCoV%E3%81%B8%E3%81%AE%E3%82%B9%E3%83%86%E3%83%AD%E3%82%A4%E3%83%89%E4%BD%BF%E7%94%A8_%282020%2C_Russell%29.pdf DL]

|-

!Edit-3

|2/7

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|狩猟食文化とnCoV

</div>

|[https://www.thelancet.com/journals/laninf/article/PIIS1473-3099(20)30063-3/fulltext Li, Jie, et al. “Game Consumption and the 2019 Novel Coronavirus.” The Lancet Infectious Diseases, 7 Feb. 2020, doi:10.1016/s1473-3099(20)30063-3.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/5/5b/200207_nCoV%E3%81%A8%E7%8B%A9%E7%8C%9F%E9%A3%9F%E6%96%87%E5%8C%96_%282020%2C_Li%29.pdf DL]

|-

!Edit-4

|2/7

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|NICUでのnCoV危機管理

</div>

|[https://www.thelancet.com/journals/lanchi/article/PIIS2352-4642(20)30040-7/fulltext Wang, Jianhui, et al. “A Contingency Plan for the Management of the 2019 Novel Coronavirus Outbreak in Neonatal Intensive Care Units.” The Lancet Child & Adolescent Health, 7 Feb. 2020, doi:10.1016/s2352-4642(20)30040-7.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/7/74/200207_nCoV-NICU%E5%8D%B1%E6%A9%9F%E7%AE%A1%E7%90%86_%282020%2C_Wang%29.pdf DL]

|-

!Edit-5

|2/8

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|PHEICの次にWHOが行うべき対応に関する取材記事

</div>

|[https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30292-0/fulltext Zarocostas, John. “What next for the Coronavirus Response?” The Lancet, vol. 395, no. 10222, 8 Feb. 2020, p. 401., doi:10.1016/s0140-6736(20)30292-0.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/e/ea/200208_nCoV-PHEIC%E3%81%AE%E6%AC%A1%E3%81%AEWHO%E5%AF%BE%E5 DL]

|-

!Edit-6

|

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|~~あいうえお~~

</div>

|~~URL~~|~~PDF~~[ DL]

|}

==関連論文：感染対策==

{|class="wikitable"

!style="width:~~60px~~4em;"|文献番号!style="width:~~40px~~3em;"|~~発表年~~発表日!style="min-width:~~280px~~20em;"|概要!style="~~min~~max-width:~~300px~~15em;"|Citation

!PDF

|-

!IC-1

|2019

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|医療従事者におけるインフルエンザ感染予防に対するN95マスクvsサージカルマスクのRCT（2019年）

</div>

|[https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2749214 Radonovich, Lewis J., et al. “N95 Respirators vs Medical Masks for Preventing Influenza Among Health Care Personnel.” JAMA, vol. 322, no. 9, 3 Sept. 2019, p. 824., doi:10.1001/jama.2019.11645.]

}}

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/8/8e/%E5%8C%BB%E7%99%82%E5%BE%93%E4%BA%8B%E8%80%85N95vs%E3%82%B5%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%82%AB%E3%83%ABflu%E4%BA%88%E9%98%B2RCT_%282019%2C_Radonovich%29.pdf DL]

|-

!IC-2

|2015

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|サージカルマスクの医療及び市中生活における感染予防効果（2015年）

*医療

**サージカルマスク vs N95マスクの比較研究が主体

**サージカルマスクに比してN95の方が気道感染のリスクは総じて低かった

*市中生活（家庭内）

**インフルエンザ等の確定患者が発生した家庭環境で，確定患者や同居家族等が，サージカルマスク・手指衛生・両者併用・無使用を実施した等の比較研究が主体

**サージカルマスク単独では，総じて無使用に比して同居家族等の二次感染発生に有意差がなかった

**サージカルマスク＋手指衛生を，家庭内で確定患者が発生した早期から，十分期間徹底した場合にのみ，同居家族等の二次感染が有意に減少した

</div>

|[https://www.bmj.com/content/350/bmj.h694 MacIntyre, C. R., and A. A. Chughtai. “Facemasks for the Prevention of Infection in Healthcare and Community Settings.” BMJ, vol. 350, no. apr09 1, 9 Apr. 2015, doi:10.1136/bmj.h694.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/c/c0/%E3%82%B5%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%82%AB%E3%83%AB%E3%83%9E%E3%82%B9%E3%82%AF%E5%8C%BB%E7%99%82vs%E5%B8%82%E4%B8%AD%E6%84%9F%E6%9F%93%E4%BA%88%E9%98%B2%EF%BC%9A%E7%B7%8F%E8%AA%AC_%282015%2C_MacIntyre%29.pdf DL]

|-

!IC-3

|

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|~~あいうえお~~

</div>

|~~URL~~|~~PDF~~[ DL]

|}

==関連論文：ワクチン==

{|class="wikitable"

!style="width:~~60px~~4em;"|文献番号!style="width:~~40px~~3em;"|~~発表年~~発表日!style="min-width:~~280px~~20em;"|概要!style="~~min~~max-width:~~300px~~15em;"|Citation

!PDF

|-

!Vac-1

|2018

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|新興ウイルス感染症に対するワクチン開発（2018年）

</div>

|[https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2676502 Graham, Barney S., et al. “Novel Vaccine Technologies.” JAMA, vol. 319, no. 14, Oct. 2018, p. 1431., doi:10.1001/jama.2018.0345.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/7/7c/%E6%96%B0%E8%88%88%E3%82%A6%E3%82%A4%E3%83%AB%E3%82%B9%E6%84%9F%E6%9F%93%E7%97%87%E3%81%AB%E5%AF%BE%E3%81%99%E3%82%8B%E3%83%AF%E3%82%AF%E3%83%81%E3%83%B3%E9%96%8B%E7%99%BA_%282018%2C_Graham%29.pdf DL]

|-

!Vac-2

|

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|~~あいうえお~~

</div>

|~~URL~~|~~PDF~~[ DL]

|}

==関連論文：感染症疫学==

{|class="wikitable"

!style="width:~~60px~~4em;"|文献番号!style="width:~~40px~~3em;"|~~発表年~~発表日!style="min-width:~~280px~~20em;"|概要!style="~~min~~max-width:~~300px~~15em;"|Citation

!PDF

|-

!IE-1

|2019

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|Endemic, Outbreak, Epidemic, Pandemicの各定義（2019年）

</div>

|[https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2726986 Grennan, Dara. “What Is a Pandemic?” JAMA, vol. 321, no. 9, 5 Mar. 2019, p. 910., doi:10.1001/jama.2019.0700.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/4/45/Endemic_Outbreak_Epidemic_Pandemic%E7%94%A8%E8%AA%9E%E5%AE%9A%E7%BE%A9_%282019%2C_Grennan%29.pdf DL]

|-

!IE-2

|2006

|class="mw-collapsible mw-collapsed"|感染症数理モデル総説

</div>

|[https://www.ism.ac.jp/editsec/toukei/pdf/54-2-461.pdf 西浦博, and 稲葉寿. “感染症流行の予測：感染症数理モデルにおける定量的課題.” 統計数理 54, no. 2 (February 6, 2006): 461–80.]

|[http://akkie.mods.jp/2019-nCoV/images/9/98/%E6%84%9F%E6%9F%93%E7%97%87%E6%95%B0%E7%90%86%E3%83%A2%E3%83%87%E3%83%AB%E7%B7%8F%E8%AA%AC_%282006%2C_%E8%A5%BF%E6%B5%A6%29.pdf DL]

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|class="mw-collapsible mw-collapsed"|~~あいうえお~~

</div>

|~~URL~~|~~PDF~~[ DL]

|}

==関連論文：重症管理==

{{quote

|content=

[https://japan.cochrane.org/ja/%E3%83%9B%E3%83%BC%E3%83%A0/%E3%80%90%E7%B7%8A%E6%80%A5%E7%89%B9%E9%9B%86%E3%80%91%E3%82%B3%E3%83%AD%E3%83%8A%E3%82%A6%E3%82%A4%E3%83%AB%E3%82%B9-2019-ncov-%EF%BC%9A%E9%87%8D%E7%97%87%E7%AE%A1%E7%90%86%E3%81%AB%E5%BD%B9%E7%AB%8B%E3%81%A4%E3%82%B3%E3%82%AF%E3%83%A9%E3%83%B3%E3%82%A8%E3%83%93%E3%83%87%E3%83%B3%E3%82%B9 コクランジャパン：<br>【緊急特集】コロナウイルス (2019-nCoV) ：重症管理に役立つコクランエビデンス]

}}

{|class="wikitable"

!style="width:~~60px~~4em;"|文献番号!style="width:~~40px~~3em;"|~~発表年~~発表日!style="min-width:~~280px~~20em;"|概要!style="~~min~~max-width:~~300px~~15em;"|Citation

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